Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmod4Q9JLH8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmod4Q9JLH8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms