Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtsmQ9JL96 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtsmQ9JL96 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsmQ9JL96 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsmQ9JL96 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsmQ9JL96 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsmQ9JL96 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsmQ9JL96 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsmQ9JL96 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsmQ9JL96 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsmQ9JL96 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsmQ9JL96 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsmQ9JL96 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsmQ9JL96 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtsmQ9JL96 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms