Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FancaQ9JL70 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FancaQ9JL70 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms