Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms