Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Scamp5Q9JKD3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scamp5Q9JKD3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms