Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pard6bQ9JK83 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms