Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sv2aQ9JIS5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sv2aQ9JIS5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms