Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod3Q9JHJ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod3Q9JHJ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod3Q9JHJ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod3Q9JHJ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod3Q9JHJ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod3Q9JHJ0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod3Q9JHJ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod3Q9JHJ0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmod3Q9JHJ0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmod3Q9JHJ0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmod3Q9JHJ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmod3Q9JHJ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms