Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek6Q9ES70 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Nek6Q9ES70 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek6Q9ES70 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms