Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp29Q9ES63 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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