Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr61Q9ERF3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr61Q9ERF3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr61Q9ERF3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr61Q9ERF3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr61Q9ERF3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr61Q9ERF3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Wdr61Q9ERF3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Wdr61Q9ERF3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms