Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MesdQ9ERE7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MesdQ9ERE7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms