Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Capn12Q9ER56 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms