Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS3

Mycbp, c-Myc-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycbpQ9EQS3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MycbpQ9EQS3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MycbpQ9EQS3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MycbpQ9EQS3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MycbpQ9EQS3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MycbpQ9EQS3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms