Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chst1Q9EQC0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chst1Q9EQC0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms