Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SgshQ9EQ08 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SgshQ9EQ08 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms