Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Aph1cQ9DCZ9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 365 ms