Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tspan4Q9DCK3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tspan4Q9DCK3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tspan4Q9DCK3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan4Q9DCK3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan4Q9DCK3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan4Q9DCK3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan4Q9DCK3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan4Q9DCK3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tspan4Q9DCK3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan4Q9DCK3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan4Q9DCK3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan4Q9DCK3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan4Q9DCK3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan4Q9DCK3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tspan4Q9DCK3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms