Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp27a1Q9DBG1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms