Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA5

1700016D06Rik, RIKEN cDNA 1700016D06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016D06RikQ9DAA5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700016D06RikQ9DAA5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700016D06RikQ9DAA5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700016D06RikQ9DAA5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700016D06RikQ9DAA5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700016D06RikQ9DAA5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700016D06RikQ9DAA5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700016D06RikQ9DAA5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700016D06RikQ9DAA5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700016D06RikQ9DAA5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700016D06RikQ9DAA5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700016D06RikQ9DAA5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700016D06RikQ9DAA5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700016D06RikQ9DAA5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
1700016D06RikQ9DAA5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms