Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DA42 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DA42 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DA42 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DA42 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DA42 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DA42 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DA42 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DA42 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DA42 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9DA42 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DA42 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DA42 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DA42 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DA42 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DA42 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DA42 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DA42 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DA42 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DA42 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DA42 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DA42 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DA42 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DA42 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DA42 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DA42 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DA42 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DA42 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DA42 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DA42 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DA42 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DA42 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DA42 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DA42 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DA42 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DA42 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DA42 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9DA42 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9DA42 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DA42 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms