Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmco5aQ9D9D5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmco5aQ9D9D5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmco5aQ9D9D5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmco5aQ9D9D5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmco5aQ9D9D5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmco5aQ9D9D5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmco5aQ9D9D5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmco5aQ9D9D5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmco5aQ9D9D5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmco5aQ9D9D5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmco5aQ9D9D5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmco5aQ9D9D5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms