Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snx5Q9D8U8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx5Q9D8U8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx5Q9D8U8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms