Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5s1Q9D742 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5s1Q9D742 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5s1Q9D742 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5s1Q9D742 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5s1Q9D742 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5s1Q9D742 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5s1Q9D742 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5s1Q9D742 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5s1Q9D742 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5s1Q9D742 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap5s1Q9D742 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms