Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pfn4Q9D6I3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pfn4Q9D6I3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms