Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tubb4aQ9D6F9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tubb4aQ9D6F9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb4aQ9D6F9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb4aQ9D6F9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tubb4aQ9D6F9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms