Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sf3a3Q9D554 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3a3Q9D554 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms