Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Zcchc13Q9D548 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Zcchc13Q9D548 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Zcchc13Q9D548 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Zcchc13Q9D548 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zcchc13Q9D548 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Zcchc13Q9D548 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Zcchc13Q9D548 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Zcchc13Q9D548 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Zcchc13Q9D548 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Zcchc13Q9D548 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Zcchc13Q9D548 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Zcchc13Q9D548 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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