Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D4W2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9D4W2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9D4W2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms