Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
4930556J24RikQ9D4U7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930556J24RikQ9D4U7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms