Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lonrf3Q9D4H7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lonrf3Q9D4H7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms