Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933428M09RikQ9D3X3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms