Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd2Q9D3B1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hacd2Q9D3B1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd2Q9D3B1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd2Q9D3B1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd2Q9D3B1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd2Q9D3B1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd2Q9D3B1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd2Q9D3B1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd2Q9D3B1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd2Q9D3B1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd2Q9D3B1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd2Q9D3B1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd2Q9D3B1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd2Q9D3B1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms