Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700034E13RikQ9D2T6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700034E13RikQ9D2T6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms