Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q9D2Q3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9D2Q3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9D2Q3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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