Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cysrt1Q9D1E4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cysrt1Q9D1E4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms