Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gtf2e1Q9D0D5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gtf2e1Q9D0D5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms