Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Acsl3Q9CZW4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acsl3Q9CZW4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms