Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab3bQ9CZT8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms