Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmss1Q9CZT6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms