Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Shisa9Q9CZN4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisa9Q9CZN4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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