Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Cnih4Q9CX13 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnih4Q9CX13 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnih4Q9CX13 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cnih4Q9CX13 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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