Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbm8aQ9CWZ3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbm8aQ9CWZ3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms