Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn1Q9CWM4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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