Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smurf1Q9CUN6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smurf1Q9CUN6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms