Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rprd1bQ9CSU0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rprd1bQ9CSU0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms