Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9CRC3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9CRC3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CRC3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CRC3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CRC3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CRC3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CRC3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q9CRC3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9CRC3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9CRC3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9CRC3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CRC3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CRC3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CRC3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9CRC3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms