Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700029F12RikQ9CRB4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms