Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ1

Hsbp1, Heat shock factor-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsbp1Q9CQZ1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hsbp1Q9CQZ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsbp1Q9CQZ1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms