Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim8Q9CQQ0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms